MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004842	GGC	2	6	268953	268958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_004842	GTAA	2	8	269088	269095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_004842	TTC	2	6	269111	269116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_004842	AAT	2	6	269121	269126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_004842	GTG	2	6	269237	269242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_004842	AAT	2	6	269276	269281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_004842	T	6	6	270343	270348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_004842	GCAC	2	8	270436	270443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_004842	TAC	2	6	270512	270517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_004842	ACT	2	6	270554	270559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_004842	T	6	6	271967	271972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_004842	TGT	2	6	272003	272008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_004842	TGT	2	6	274601	274606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_004842	T	6	6	274624	274629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_004842	AGGG	2	8	274632	274639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_004842	GC	3	6	274652	274657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_004842	GAT	3	9	274738	274746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_004842	ATC	2	6	274814	274819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_004842	A	7	7	274820	274826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_004842	T	7	7	275941	275947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_004842	TAA	2	6	275971	275976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_004842	CA	3	6	275997	276002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_004842	TGAC	2	8	277322	277329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_004842	CAA	2	6	277355	277360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_004842	TA	3	6	277381	277386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_004842	CTG	2	6	280883	280888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_004842	A	7	7	280900	280906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_004842	TGC	2	6	280912	280917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_004842	GTT	2	6	280926	280931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_004842	GTT	2	6	280970	280975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_004842	GTA	2	6	280994	280999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_004842	C	6	6	282243	282248	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1033	NC_004842	CG	3	6	282250	282255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_004842	TAATA	2	10	284115	284124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_004842	CA	3	6	284165	284170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_004842	ACA	2	6	284315	284320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_004842	CTG	2	6	284336	284341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_004842	TGGGCT	2	12	284374	284385	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1039	NC_004842	CTG	2	6	284541	284546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_004842	CTTG	2	8	285864	285871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_004842	GAC	2	6	285881	285886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_004842	CTG	2	6	286958	286963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_004842	GTA	2	6	287012	287017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_004842	TGT	2	6	287027	287032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_004842	CG	3	6	287054	287059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_004842	GTT	2	6	287088	287093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_004842	TGA	2	6	288581	288586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_004842	CGC	2	6	288603	288608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_004842	AT	3	6	288985	288990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_004842	A	6	6	289004	289009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_004842	CCG	2	6	289054	289059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_004842	CTGC	2	8	289130	289137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_004842	CGG	2	6	289155	289160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_004842	GC	3	6	289196	289201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_004842	CCA	2	6	289303	289308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_004842	CTC	2	6	289323	289328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_004842	A	6	6	289372	289377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_004842	CG	3	6	289464	289469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_004842	GGAC	2	8	289482	289489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_004842	ACGC	2	8	289502	289509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_004842	AGC	2	6	289513	289518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_004842	TCG	2	6	289791	289796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_004842	G	6	6	289848	289853	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004842	GCCT	2	8	291182	291189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_004842	T	6	6	291220	291225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004842	TGA	2	6	291304	291309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_004842	CAA	2	6	291668	291673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_004842	CTG	2	6	291771	291776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_004842	TTA	2	6	291823	291828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_004842	TAT	2	6	291843	291848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004842	GCC	2	6	291875	291880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_004842	GT	4	8	292049	292056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004842	AGTTG	2	10	292099	292108	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004842	G	11	11	292977	292987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004842	ACCT	2	8	293007	293014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_004842	C	6	6	293022	293027	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1077	NC_004842	G	11	11	293031	293041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_004842	CGG	3	9	293093	293101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_004842	TGG	2	6	293112	293117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_004842	TTA	2	6	296739	296744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_004842	AAC	2	6	296775	296780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_004842	AC	3	6	296779	296784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_004842	ATT	2	6	297592	297597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_004842	TTC	2	6	298165	298170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_004842	GT	3	6	298213	298218	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_004842	G	6	6	298219	298224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_004842	AGC	2	6	300965	300970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_004842	CATG	2	8	301011	301018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_004842	CGG	2	6	301032	301037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_004842	AAC	2	6	305937	305942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_004842	ATT	2	6	305996	306001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_004842	T	7	7	306000	306006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_004842	TGA	2	6	306023	306028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_004842	T	6	6	306029	306034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_004842	ATT	2	6	306039	306044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004842	CG	3	6	306057	306062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_004842	GTA	2	6	306063	306068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004842	GTGC	2	8	306111	306118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_004842	C	9	9	310326	310334	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1100	NC_004842	GCG	2	6	310354	310359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_004842	GC	3	6	310375	310380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_004842	CAA	2	6	310426	310431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_004842	TTG	2	6	310436	310441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004842	TG	3	6	310444	310449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004842	AGG	2	6	310488	310493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004842	CCT	2	6	310518	310523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_004842	TGA	2	6	310524	310529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004842	ACC	2	6	310533	310538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_004842	CAC	2	6	310582	310587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_004842	TGA	2	6	311013	311018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004842	T	6	6	311139	311144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004842	AGC	2	6	311202	311207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_004842	TGA	2	6	319760	319765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_004842	ACG	2	6	319798	319803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_004842	CG	3	6	319835	319840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_004842	AGG	2	6	319860	319865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_004842	TAT	2	6	319889	319894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004842	ATT	2	6	319897	319902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004842	CA	4	8	319924	319931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_004842	TGC	2	6	319961	319966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_004842	CGC	2	6	323120	323125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_004842	CAGT	2	8	323149	323156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_004842	GGTTG	2	10	323181	323190	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004842	CCA	2	6	323194	323199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_004842	GTT	2	6	323274	323279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_004842	CTG	2	6	323362	323367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_004842	GGGTTT	2	12	323433	323444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004842	CAAT	2	8	325569	325576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_004842	TTG	2	6	325642	325647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004842	TTA	2	6	325681	325686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004842	GT	4	8	325705	325712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004842	ATA	2	6	325718	325723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004842	AGT	2	6	325738	325743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004842	CTG	2	6	325745	325750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_004842	G	10	10	325750	325759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_004842	TCC	2	6	325761	325766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_004842	AAC	2	6	325767	325772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1251	NC_004842	CA	3	6	349250	349255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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